Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKP1Q13835 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PKP1Q13835 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PKP1Q13835 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
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