Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3CQ13748 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA3CQ13748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA3CQ13748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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