Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XRCC4Q13426 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XRCC4Q13426 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XRCC4Q13426 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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