Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
GRIN2BQ13224 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.35■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
GRIN2BQ13224 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
GRIN2BQ13224 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
GRIN2BQ13224 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
GRIN2BQ13224 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
GRIN2BQ13224 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.07■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
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