Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX3Q13185 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX3Q13185 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX3Q13185 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX3Q13185 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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