Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.76□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.76□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 ADE1YAR015W 921 nt6.76□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 YOR343CYOR343C 327 nt6.76□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 MTC6YHR151C 1581 nt6.75□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 YER137CYER137C 447 nt6.75□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 RRT6YGL146C 936 nt6.75□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 YIP4YGL198W 708 nt6.75□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 PMT1YDL095W 2454 nt6.75□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 NUP53YMR153W 1428 nt6.75□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 DST1YGL043W 930 nt6.74□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 TPO1YLL028W 1761 nt6.74□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 PSP2YML017W 1782 nt6.73□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 CPR2YHR057C 618 nt6.73□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 BUD20YLR074C 501 nt6.73□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 CDA1YLR307W 906 nt6.73□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 MET13YGL125W 1803 nt6.73□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.72□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 ECM30YLR436C 3825 nt6.71□□□□□ -1.33
HMS1Q12398 MNN9YPL050C 1188 nt6.71□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 MET8YBR213W 825 nt6.71□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 DAL7YIR031C 1665 nt6.71□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 HAC1YFL031W 717 nt6.7□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 AOS1YPR180W 1044 nt6.7□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 SPR1YOR190W 1338 nt6.7□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 TES1YJR019C 1050 nt6.69□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 CPT1YNL130C 1182 nt6.69□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 PNS1YOR161C 1620 nt6.68□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 YEN1YER041W 2280 nt6.68□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 PUS7YOR243C 2031 nt6.68□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 YJL043WYJL043W 774 nt6.68□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 HAM1YJR069C 594 nt6.68□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 TOS1YBR162C 1368 nt6.68□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 AVL9YLR114C 2295 nt6.67□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 STE3YKL178C 1413 nt6.67□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 CIR2YOR356W 1896 nt6.67□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 VBA5YKR105C 1749 nt6.67□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 CKB1YGL019W 837 nt6.66□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.66□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 FUS3YBL016W 1062 nt6.66□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 ECM27YJR106W 2178 nt6.66□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 PDC5YLR134W 1692 nt6.65□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 PEX28YHR150W 1740 nt6.65□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 RPL12BYDR418W 498 nt6.65□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 YHR033WYHR033W 1272 nt6.65□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 MEU1YLR017W 1014 nt6.65□□□□□ -1.34
HMS1Q12398 YNL295WYNL295W 1575 nt6.65□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 RRP43YCR035C 1185 nt6.63□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 EMP65YER140W 1671 nt6.63□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 YKR018CYKR018C 2178 nt6.62□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 PPZ2YDR436W 2133 nt6.62□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 DAL4YIR028W 1908 nt6.62□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 YLL058WYLL058W 1728 nt6.62□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 YDR215CYDR215C 414 nt6.62□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 SGF73YGL066W 1974 nt6.62□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 YDR476CYDR476C 675 nt6.61□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 EDC2YER035W 438 nt6.61□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 VPS65YLR322W 315 nt6.61□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 ERV25YML012W 636 nt6.61□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 INP54YOL065C 1155 nt6.61□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 RSC9YML127W 1746 nt6.61□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 RUP1YOR138C 2016 nt6.6□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 PET494YNR045W 1470 nt6.6□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 PET10YKR046C 852 nt6.6□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.6□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 SKY1YMR216C 2229 nt6.6□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 TPK1YJL164C 1194 nt6.59□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 ERV2YPR037C 591 nt6.59□□□□□ -1.35
HMS1Q12398 QCR6YFR033C 444 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 NCA3YJL116C 1014 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 HMS2YJR147W 1077 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 KAE1YKR038C 1161 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 YPC1YBR183W 951 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 SPS1YDR523C 1473 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 PRB1YEL060C 1908 nt6.58□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 LEO1YOR123C 1395 nt6.57□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 PSA1YDL055C 1086 nt6.57□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 SNA3YJL151C 402 nt6.57□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 DAL80YKR034W 810 nt6.57□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 GET2YER083C 858 nt6.55□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 CAR2YLR438W 1275 nt6.55□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.55□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 RFS1YBR052C 633 nt6.55□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 BDS1YOL164W 1941 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 SRF1YDL133W 1314 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 OPI1YHL020C 1215 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 STS1YIR011C 960 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 YJR142WYJR142W 1029 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 SNF7YLR025W 723 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 CLN1YMR199W 1641 nt6.54□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 TOD6YBL054W 1578 nt6.53□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 VMA2YBR127C 1554 nt6.53□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 RSP5YER125W 2430 nt6.53□□□□□ -1.36
HMS1Q12398 YBL113CYBL113C 2379 nt6.52□□□□□ -1.37
HMS1Q12398 NMA2YGR010W 1188 nt6.52□□□□□ -1.37
HMS1Q12398 YLR030WYLR030W 792 nt6.52□□□□□ -1.37
HMS1Q12398 YPT10YBR264C 600 nt6.52□□□□□ -1.37
HMS1Q12398 SEC24YIL109C 2781 nt6.52□□□□□ -1.37
HMS1Q12398 YLR358CYLR358C 564 nt6.51□□□□□ -1.37
HMS1Q12398 DSC3YOR223W 879 nt6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms