Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSM1Q08AH1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSM1Q08AH1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms