Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF11Q05519 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF11Q05519 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms