Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSTF1Q05048 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF1Q05048 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms