Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2BQ02880 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2BQ02880 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2BQ02880 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOP2BQ02880 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TOP2BQ02880 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOP2BQ02880 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2BQ02880 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.43
TOP2BQ02880 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2BQ02880 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
TOP2BQ02880 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms