Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EXOSC10Q01780 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC10Q01780 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC10Q01780 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
EXOSC10Q01780 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms