Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F1Q01094 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F1Q01094 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms