Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYBPC1Q00872 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYBPC1Q00872 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYBPC1Q00872 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYBPC1Q00872 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYBPC1Q00872 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYBPC1Q00872 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYBPC1Q00872 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYBPC1Q00872 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms