Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKB2Q00653 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB2Q00653 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKB2Q00653 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms