Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PITPNAQ00169 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PITPNAQ00169 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms