Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBP5P82980 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBP5P82980 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBP5P82980 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBP5P82980 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBP5P82980 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBP5P82980 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBP5P82980 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBP5P82980 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBP5P82980 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBP5P82980 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBP5P82980 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RBP5P82980 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBP5P82980 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBP5P82980 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBP5P82980 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBP5P82980 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBP5P82980 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBP5P82980 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBP5P82980 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBP5P82980 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBP5P82980 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBP5P82980 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBP5P82980 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBP5P82980 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBP5P82980 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RBP5P82980 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBP5P82980 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBP5P82980 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBP5P82980 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBP5P82980 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RBP5P82980 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBP5P82980 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBP5P82980 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBP5P82980 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBP5P82980 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBP5P82980 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBP5P82980 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBP5P82980 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBP5P82980 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBP5P82980 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBP5P82980 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBP5P82980 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBP5P82980 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RBP5P82980 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBP5P82980 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBP5P82980 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBP5P82980 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBP5P82980 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBP5P82980 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBP5P82980 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RBP5P82980 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBP5P82980 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBP5P82980 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBP5P82980 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBP5P82980 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBP5P82980 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBP5P82980 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RBP5P82980 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBP5P82980 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBP5P82980 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBP5P82980 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RBP5P82980 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBP5P82980 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBP5P82980 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBP5P82980 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBP5P82980 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBP5P82980 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBP5P82980 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBP5P82980 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBP5P82980 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBP5P82980 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBP5P82980 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBP5P82980 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBP5P82980 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms