Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFI35P80217 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFI35P80217 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFI35P80217 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFI35P80217 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFI35P80217 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFI35P80217 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFI35P80217 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFI35P80217 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFI35P80217 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFI35P80217 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFI35P80217 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFI35P80217 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFI35P80217 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFI35P80217 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFI35P80217 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFI35P80217 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFI35P80217 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFI35P80217 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFI35P80217 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFI35P80217 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFI35P80217 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFI35P80217 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFI35P80217 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFI35P80217 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFI35P80217 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFI35P80217 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IFI35P80217 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFI35P80217 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFI35P80217 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFI35P80217 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFI35P80217 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFI35P80217 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFI35P80217 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFI35P80217 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFI35P80217 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFI35P80217 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFI35P80217 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFI35P80217 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFI35P80217 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFI35P80217 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFI35P80217 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFI35P80217 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFI35P80217 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IFI35P80217 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFI35P80217 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFI35P80217 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFI35P80217 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFI35P80217 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFI35P80217 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFI35P80217 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFI35P80217 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFI35P80217 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFI35P80217 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFI35P80217 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFI35P80217 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFI35P80217 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFI35P80217 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFI35P80217 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFI35P80217 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFI35P80217 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFI35P80217 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFI35P80217 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFI35P80217 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFI35P80217 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFI35P80217 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFI35P80217 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFI35P80217 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFI35P80217 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFI35P80217 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFI35P80217 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFI35P80217 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFI35P80217 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFI35P80217 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFI35P80217 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFI35P80217 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms