Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HBG1P69891 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HBG1P69891 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBG1P69891 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HBG1P69891 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBG1P69891 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBG1P69891 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBG1P69891 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBG1P69891 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBG1P69891 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBG1P69891 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBG1P69891 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBG1P69891 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBG1P69891 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBG1P69891 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HBG1P69891 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBG1P69891 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBG1P69891 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBG1P69891 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBG1P69891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBG1P69891 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBG1P69891 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBG1P69891 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBG1P69891 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBG1P69891 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBG1P69891 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBG1P69891 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBG1P69891 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBG1P69891 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBG1P69891 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBG1P69891 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBG1P69891 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBG1P69891 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBG1P69891 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBG1P69891 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBG1P69891 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBG1P69891 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBG1P69891 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBG1P69891 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBG1P69891 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBG1P69891 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBG1P69891 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBG1P69891 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBG1P69891 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBG1P69891 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBG1P69891 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HBG1P69891 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HBG1P69891 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HBG1P69891 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HBG1P69891 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBG1P69891 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBG1P69891 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBG1P69891 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBG1P69891 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBG1P69891 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms