Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA4AP68366 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4AP68366 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4AP68366 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA4AP68366 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms