Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VSNL1P62760 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSNL1P62760 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSNL1P62760 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSNL1P62760 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms