Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN5P62079 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN5P62079 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN5P62079 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN5P62079 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN5P62079 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN5P62079 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN5P62079 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN5P62079 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN5P62079 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN5P62079 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN5P62079 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN5P62079 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN5P62079 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN5P62079 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN5P62079 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN5P62079 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN5P62079 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN5P62079 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN5P62079 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN5P62079 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN5P62079 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN5P62079 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN5P62079 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN5P62079 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN5P62079 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN5P62079 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN5P62079 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms