Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01547P58512 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms