Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH15P55291 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH15P55291 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH15P55291 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH15P55291 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH15P55291 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH15P55291 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH15P55291 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH15P55291 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH15P55291 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH15P55291 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH15P55291 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH15P55291 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH15P55291 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH15P55291 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH15P55291 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH15P55291 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH15P55291 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH15P55291 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH15P55291 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH15P55291 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH15P55291 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH15P55291 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH15P55291 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH15P55291 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH15P55291 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH15P55291 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH15P55291 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH15P55291 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH15P55291 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH15P55291 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH15P55291 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH15P55291 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH15P55291 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH15P55291 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH15P55291 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH15P55291 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH15P55291 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH15P55291 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH15P55291 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH15P55291 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH15P55291 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH15P55291 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH15P55291 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH15P55291 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH15P55291 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH15P55291 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH15P55291 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH15P55291 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH15P55291 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH15P55291 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH15P55291 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH15P55291 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH15P55291 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH15P55291 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH15P55291 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH15P55291 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH15P55291 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH15P55291 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH15P55291 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH15P55291 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH15P55291 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH15P55291 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH15P55291 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH15P55291 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH15P55291 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH15P55291 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH15P55291 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH15P55291 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH15P55291 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH15P55291 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH15P55291 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH15P55291 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH15P55291 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH15P55291 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms