Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLTPP55058 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLTPP55058 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLTPP55058 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLTPP55058 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLTPP55058 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLTPP55058 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLTPP55058 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PLTPP55058 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLTPP55058 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PLTPP55058 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLTPP55058 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLTPP55058 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLTPP55058 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLTPP55058 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLTPP55058 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PLTPP55058 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLTPP55058 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLTPP55058 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLTPP55058 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLTPP55058 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLTPP55058 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLTPP55058 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLTPP55058 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLTPP55058 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLTPP55058 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLTPP55058 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLTPP55058 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLTPP55058 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLTPP55058 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLTPP55058 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLTPP55058 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLTPP55058 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLTPP55058 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLTPP55058 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLTPP55058 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLTPP55058 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLTPP55058 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLTPP55058 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLTPP55058 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLTPP55058 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLTPP55058 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLTPP55058 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLTPP55058 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLTPP55058 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLTPP55058 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLTPP55058 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLTPP55058 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLTPP55058 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLTPP55058 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLTPP55058 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLTPP55058 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLTPP55058 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLTPP55058 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLTPP55058 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLTPP55058 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLTPP55058 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLTPP55058 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLTPP55058 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLTPP55058 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLTPP55058 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms