Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRLP54845 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRLP54845 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRLP54845 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRLP54845 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRLP54845 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRLP54845 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRLP54845 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NRLP54845 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NRLP54845 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRLP54845 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRLP54845 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NRLP54845 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRLP54845 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRLP54845 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRLP54845 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRLP54845 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRLP54845 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRLP54845 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRLP54845 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRLP54845 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRLP54845 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRLP54845 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRLP54845 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRLP54845 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRLP54845 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRLP54845 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRLP54845 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRLP54845 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRLP54845 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRLP54845 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRLP54845 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRLP54845 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRLP54845 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRLP54845 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRLP54845 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRLP54845 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NRLP54845 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRLP54845 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRLP54845 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRLP54845 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRLP54845 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRLP54845 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRLP54845 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NRLP54845 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRLP54845 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRLP54845 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRLP54845 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRLP54845 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRLP54845 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRLP54845 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRLP54845 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRLP54845 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRLP54845 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRLP54845 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRLP54845 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRLP54845 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRLP54845 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRLP54845 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRLP54845 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRLP54845 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRLP54845 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRLP54845 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRLP54845 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRLP54845 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRLP54845 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRLP54845 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRLP54845 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRLP54845 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRLP54845 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRLP54845 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms