Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATXN1P54253 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN1P54253 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATXN1P54253 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms