Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BLMP54132 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BLMP54132 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
BLMP54132 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BLMP54132 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BLMP54132 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BLMP54132 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BLMP54132 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BLMP54132 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BLMP54132 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BLMP54132 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
BLMP54132 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
BLMP54132 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BLMP54132 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BLMP54132 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
BLMP54132 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BLMP54132 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BLMP54132 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BLMP54132 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BLMP54132 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BLMP54132 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BLMP54132 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BLMP54132 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BLMP54132 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BLMP54132 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BLMP54132 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
BLMP54132 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
BLMP54132 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BLMP54132 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BLMP54132 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BLMP54132 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BLMP54132 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BLMP54132 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BLMP54132 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BLMP54132 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BLMP54132 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BLMP54132 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BLMP54132 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BLMP54132 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BLMP54132 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BLMP54132 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BLMP54132 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BLMP54132 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BLMP54132 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
BLMP54132 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BLMP54132 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BLMP54132 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
BLMP54132 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BLMP54132 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BLMP54132 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BLMP54132 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BLMP54132 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BLMP54132 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
BLMP54132 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BLMP54132 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BLMP54132 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BLMP54132 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BLMP54132 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
BLMP54132 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BLMP54132 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BLMP54132 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
BLMP54132 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BLMP54132 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BLMP54132 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BLMP54132 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BLMP54132 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
BLMP54132 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BLMP54132 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BLMP54132 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
BLMP54132 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BLMP54132 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BLMP54132 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BLMP54132 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BLMP54132 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BLMP54132 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BLMP54132 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BLMP54132 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BLMP54132 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BLMP54132 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
BLMP54132 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BLMP54132 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BLMP54132 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BLMP54132 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BLMP54132 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
BLMP54132 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BLMP54132 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BLMP54132 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BLMP54132 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms