Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP2S1P53680 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP2S1P53680 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms