Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 426.75■■□□□ 1.872e-7■■■■■ 38
HNRNPMP52272 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 423.44■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 38
HNRNPMP52272 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.511e-8■■■■■ 38
HNRNPMP52272 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 38
HNRNPMP52272 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 38
HNRNPMP52272 ZNF236-203ENST00000543926 8206 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.433e-13■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.513e-13■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.572e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.872e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)25.02■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 321.28■■□□□ 12e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 214.33□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 37.9
HNRNPMP52272 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.814e-13■■■■■ 37.8
HNRNPMP52272 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 25.49□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 38.46□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 TCF7L2-208ENST00000369389 691 ntTSL 437.7■■■■□ 3.633e-9■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 TCF7L2-203ENST00000349937 725 ntTSL 49.6□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 TCF7L2-228ENST00000637321 430 ntTSL 54.43□□□□□ -1.73e-9■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 35.44□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 37.7
HNRNPMP52272 ZNF100-205ENST00000598026 588 ntTSL 421.48■■□□□ 1.031e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 ZNF100-204ENST00000596452 464 ntTSL 313.33□□□□□ -0.281e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 LMBR1-218ENST00000486837 576 ntTSL 25.84□□□□□ -1.478e-7■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.014e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.964e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.914e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.864e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 531.31■■■□□ 2.64e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.74e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 515.03■□□□□ -04e-9■■■■■ 37.6
HNRNPMP52272 AP2A2-210ENST00000527024 527 ntTSL 426.75■■□□□ 1.874e-8■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 XPO6-213ENST00000568065 942 ntTSL 529.61■■■□□ 2.334e-8■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-206ENST00000566105 262 ntTSL 336.89■■■■□ 3.51e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-205ENST00000564989 261 ntTSL 335.52■■■■□ 3.281e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.671e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.611e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.611e-7■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)22.44■■□□□ 1.181e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-204ENST00000563356 560 ntTSL 420.44■□□□□ 0.861e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 ZFP1-202ENST00000393430 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-9■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 FBXL17-202ENST00000481160 604 ntTSL 34.63□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 323.26■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 37.5
HNRNPMP52272 BACH1-212ENST00000548467 217 ntTSL 23.45□□□□□ -1.863e-7■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 230.96■■■□□ 2.555e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.275e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.255e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.045e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-218ENST00000635909 2212 ntTSL 525.73■■□□□ 1.715e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.585e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-224ENST00000638143 563 ntTSL 524.95■■□□□ 1.585e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-222ENST00000637468 650 ntTSL 524.27■■□□□ 1.485e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 SPG7-205ENST00000561945 411 ntTSL 323.54■■□□□ 1.365e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-220ENST00000636005 1355 ntTSL 523.06■■□□□ 1.285e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.225e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 522.53■■□□□ 1.25e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.125e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 521.66■■□□□ 1.065e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.015e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.055e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-206ENST00000429440 2501 ntTSL 210.99□□□□□ -0.655e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-208ENST00000442054 3786 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.675e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)7.8□□□□□ -1.165e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.295e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.325e-11■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 24.46□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 323.58■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 37.4
HNRNPMP52272 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 MRPL33-203ENST00000448427 527 ntTSL 416.37■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 MRPL33-206ENST00000483992 729 ntTSL 211.96□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 MRPL33-205ENST00000476552 587 ntTSL 210.13□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 KMT5B-209ENST00000441488 2816 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.495e-11■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 KMT5B-202ENST00000323599 653 ntTSL 310.64□□□□□ -0.715e-11■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 KMT5B-213ENST00000524672 662 ntTSL 47.58□□□□□ -1.25e-11■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.285e-11■■■■■ 37.3
HNRNPMP52272 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 37.1
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 319.7 ms