Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP11P51784 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP11P51784 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP11P51784 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP11P51784 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP11P51784 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP11P51784 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP11P51784 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP11P51784 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP11P51784 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP11P51784 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP11P51784 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP11P51784 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP11P51784 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP11P51784 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP11P51784 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP11P51784 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP11P51784 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP11P51784 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP11P51784 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP11P51784 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP11P51784 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP11P51784 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP11P51784 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP11P51784 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP11P51784 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP11P51784 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP11P51784 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP11P51784 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP11P51784 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP11P51784 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP11P51784 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP11P51784 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP11P51784 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP11P51784 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP11P51784 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP11P51784 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP11P51784 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP11P51784 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP11P51784 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP11P51784 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP11P51784 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP11P51784 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP11P51784 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP11P51784 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP11P51784 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP11P51784 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP11P51784 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP11P51784 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP11P51784 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP11P51784 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP11P51784 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP11P51784 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP11P51784 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP11P51784 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP11P51784 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP11P51784 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP11P51784 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP11P51784 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP11P51784 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP11P51784 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP11P51784 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP11P51784 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP11P51784 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP11P51784 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP11P51784 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP11P51784 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP11P51784 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP11P51784 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP11P51784 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP11P51784 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP11P51784 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP11P51784 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP11P51784 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP11P51784 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP11P51784 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP11P51784 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP11P51784 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP11P51784 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP11P51784 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP11P51784 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP11P51784 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP11P51784 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP11P51784 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms