Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM2P49643 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM2P49643 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRIM2P49643 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms