Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSR1P43307 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSR1P43307 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSR1P43307 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSR1P43307 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSR1P43307 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSR1P43307 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSR1P43307 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSR1P43307 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSR1P43307 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSR1P43307 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSR1P43307 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSR1P43307 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSR1P43307 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSR1P43307 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSR1P43307 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSR1P43307 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSR1P43307 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSR1P43307 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSR1P43307 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSR1P43307 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSR1P43307 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSR1P43307 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSR1P43307 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSR1P43307 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSR1P43307 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSR1P43307 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSR1P43307 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSR1P43307 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSR1P43307 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSR1P43307 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSR1P43307 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSR1P43307 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSR1P43307 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSR1P43307 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSR1P43307 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSR1P43307 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSR1P43307 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSR1P43307 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSR1P43307 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SSR1P43307 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSR1P43307 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSR1P43307 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSR1P43307 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSR1P43307 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSR1P43307 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSR1P43307 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSR1P43307 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSR1P43307 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSR1P43307 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSR1P43307 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSR1P43307 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSR1P43307 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSR1P43307 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSR1P43307 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSR1P43307 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SSR1P43307 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSR1P43307 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSR1P43307 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSR1P43307 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSR1P43307 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSR1P43307 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSR1P43307 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSR1P43307 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSR1P43307 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSR1P43307 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSR1P43307 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSR1P43307 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSR1P43307 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSR1P43307 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSR1P43307 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSR1P43307 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSR1P43307 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSR1P43307 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSR1P43307 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSR1P43307 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSR1P43307 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSR1P43307 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSR1P43307 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSR1P43307 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSR1P43307 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSR1P43307 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSR1P43307 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSR1P43307 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSR1P43307 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSR1P43307 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSR1P43307 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSR1P43307 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms