Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL13AP40429 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL13AP40429 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms