Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX2P40425 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX2P40425 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX2P40425 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX2P40425 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX2P40425 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX2P40425 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX2P40425 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX2P40425 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBX2P40425 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX2P40425 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX2P40425 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX2P40425 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX2P40425 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX2P40425 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX2P40425 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX2P40425 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX2P40425 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX2P40425 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX2P40425 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX2P40425 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX2P40425 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX2P40425 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX2P40425 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX2P40425 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX2P40425 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX2P40425 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX2P40425 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX2P40425 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX2P40425 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX2P40425 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PBX2P40425 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX2P40425 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX2P40425 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX2P40425 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX2P40425 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX2P40425 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX2P40425 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX2P40425 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX2P40425 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX2P40425 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX2P40425 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX2P40425 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX2P40425 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX2P40425 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX2P40425 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX2P40425 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX2P40425 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX2P40425 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX2P40425 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX2P40425 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX2P40425 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX2P40425 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX2P40425 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX2P40425 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX2P40425 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX2P40425 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX2P40425 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX2P40425 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX2P40425 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX2P40425 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX2P40425 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX2P40425 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX2P40425 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX2P40425 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX2P40425 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX2P40425 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX2P40425 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX2P40425 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX2P40425 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX2P40425 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX2P40425 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PBX2P40425 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX2P40425 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX2P40425 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms