Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGCXP38435 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGCXP38435 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGCXP38435 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGCXP38435 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGCXP38435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGCXP38435 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGCXP38435 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGCXP38435 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGCXP38435 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGCXP38435 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGCXP38435 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGCXP38435 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGCXP38435 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGCXP38435 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGCXP38435 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGCXP38435 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGCXP38435 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGCXP38435 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGCXP38435 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGCXP38435 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGCXP38435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGCXP38435 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGCXP38435 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGCXP38435 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGCXP38435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGCXP38435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGCXP38435 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGCXP38435 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGCXP38435 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGCXP38435 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GGCXP38435 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GGCXP38435 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GGCXP38435 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGCXP38435 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
GGCXP38435 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGCXP38435 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGCXP38435 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGCXP38435 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGCXP38435 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGCXP38435 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGCXP38435 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGCXP38435 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGCXP38435 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGCXP38435 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGCXP38435 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGCXP38435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGCXP38435 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGCXP38435 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGCXP38435 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGCXP38435 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGCXP38435 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGCXP38435 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GGCXP38435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GGCXP38435 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGCXP38435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGCXP38435 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms