Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA5AP35218 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CA5AP35218 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA5AP35218 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA5AP35218 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA5AP35218 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA5AP35218 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA5AP35218 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA5AP35218 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA5AP35218 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CA5AP35218 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA5AP35218 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA5AP35218 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA5AP35218 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA5AP35218 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA5AP35218 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA5AP35218 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA5AP35218 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA5AP35218 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA5AP35218 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA5AP35218 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA5AP35218 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA5AP35218 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA5AP35218 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA5AP35218 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA5AP35218 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA5AP35218 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA5AP35218 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA5AP35218 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA5AP35218 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CA5AP35218 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA5AP35218 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CA5AP35218 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CA5AP35218 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CA5AP35218 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA5AP35218 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA5AP35218 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA5AP35218 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA5AP35218 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA5AP35218 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA5AP35218 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA5AP35218 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA5AP35218 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CA5AP35218 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA5AP35218 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CA5AP35218 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA5AP35218 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA5AP35218 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA5AP35218 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA5AP35218 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA5AP35218 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA5AP35218 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA5AP35218 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA5AP35218 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA5AP35218 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA5AP35218 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA5AP35218 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA5AP35218 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA5AP35218 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CA5AP35218 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA5AP35218 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA5AP35218 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA5AP35218 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA5AP35218 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA5AP35218 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA5AP35218 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CA5AP35218 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA5AP35218 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA5AP35218 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA5AP35218 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA5AP35218 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA5AP35218 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA5AP35218 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CA5AP35218 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CA5AP35218 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CA5AP35218 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CA5AP35218 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CA5AP35218 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CA5AP35218 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CA5AP35218 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CA5AP35218 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA5AP35218 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CA5AP35218 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA5AP35218 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA5AP35218 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA5AP35218 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA5AP35218 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA5AP35218 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CA5AP35218 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CA5AP35218 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CA5AP35218 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CA5AP35218 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CA5AP35218 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms