Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2BP30876 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2BP30876 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2BP30876 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2BP30876 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms