Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB2P29323 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB2P29323 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB2P29323 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB2P29323 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB2P29323 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB2P29323 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB2P29323 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB2P29323 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.1 ms