Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB5P28074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB5P28074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB5P28074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms