Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB9P28065 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB9P28065 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB9P28065 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms