Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD27P26842 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD27P26842 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD27P26842 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD27P26842 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD27P26842 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD27P26842 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD27P26842 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD27P26842 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD27P26842 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD27P26842 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD27P26842 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD27P26842 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD27P26842 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD27P26842 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CD27P26842 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD27P26842 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD27P26842 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD27P26842 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD27P26842 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD27P26842 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD27P26842 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD27P26842 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD27P26842 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD27P26842 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CD27P26842 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD27P26842 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD27P26842 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD27P26842 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD27P26842 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD27P26842 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD27P26842 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD27P26842 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD27P26842 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD27P26842 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD27P26842 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD27P26842 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD27P26842 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD27P26842 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD27P26842 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD27P26842 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD27P26842 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD27P26842 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD27P26842 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CD27P26842 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD27P26842 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD27P26842 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD27P26842 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD27P26842 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD27P26842 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD27P26842 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD27P26842 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD27P26842 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD27P26842 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD27P26842 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD27P26842 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD27P26842 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD27P26842 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD27P26842 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD27P26842 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD27P26842 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD27P26842 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD27P26842 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD27P26842 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD27P26842 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD27P26842 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD27P26842 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD27P26842 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD27P26842 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD27P26842 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD27P26842 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD27P26842 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD27P26842 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CD27P26842 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD27P26842 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD27P26842 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD27P26842 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms