Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTFP26441 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTFP26441 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTFP26441 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTFP26441 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTFP26441 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTFP26441 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTFP26441 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTFP26441 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTFP26441 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTFP26441 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTFP26441 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTFP26441 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTFP26441 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTFP26441 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTFP26441 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTFP26441 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTFP26441 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTFP26441 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTFP26441 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTFP26441 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTFP26441 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTFP26441 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTFP26441 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTFP26441 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTFP26441 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTFP26441 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTFP26441 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTFP26441 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTFP26441 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTFP26441 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTFP26441 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTFP26441 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTFP26441 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTFP26441 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTFP26441 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTFP26441 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTFP26441 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTFP26441 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTFP26441 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTFP26441 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTFP26441 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTFP26441 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTFP26441 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTFP26441 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTFP26441 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTFP26441 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTFP26441 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTFP26441 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTFP26441 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTFP26441 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTFP26441 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTFP26441 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTFP26441 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTFP26441 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTFP26441 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTFP26441 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTFP26441 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTFP26441 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTFP26441 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTFP26441 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTFP26441 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTFP26441 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTFP26441 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTFP26441 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTFP26441 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTFP26441 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTFP26441 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTFP26441 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTFP26441 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTFP26441 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTFP26441 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTFP26441 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTFP26441 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTFP26441 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTFP26441 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTFP26441 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTFP26441 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTFP26441 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTFP26441 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTFP26441 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTFP26441 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTFP26441 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTFP26441 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTFP26441 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTFP26441 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTFP26441 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTFP26441 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTFP26441 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTFP26441 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTFP26441 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms