Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBG1P23258 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBG1P23258 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBG1P23258 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms