Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCP2P22307 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCP2P22307 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCP2P22307 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCP2P22307 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCP2P22307 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCP2P22307 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCP2P22307 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCP2P22307 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCP2P22307 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCP2P22307 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCP2P22307 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCP2P22307 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCP2P22307 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCP2P22307 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCP2P22307 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCP2P22307 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCP2P22307 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCP2P22307 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCP2P22307 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCP2P22307 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCP2P22307 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCP2P22307 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCP2P22307 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCP2P22307 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCP2P22307 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCP2P22307 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCP2P22307 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCP2P22307 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCP2P22307 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCP2P22307 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCP2P22307 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCP2P22307 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCP2P22307 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCP2P22307 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCP2P22307 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCP2P22307 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCP2P22307 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCP2P22307 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCP2P22307 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCP2P22307 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCP2P22307 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCP2P22307 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCP2P22307 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCP2P22307 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCP2P22307 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCP2P22307 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCP2P22307 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCP2P22307 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCP2P22307 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCP2P22307 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCP2P22307 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCP2P22307 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCP2P22307 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCP2P22307 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCP2P22307 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCP2P22307 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCP2P22307 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SCP2P22307 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCP2P22307 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCP2P22307 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCP2P22307 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCP2P22307 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCP2P22307 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCP2P22307 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCP2P22307 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCP2P22307 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCP2P22307 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCP2P22307 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCP2P22307 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCP2P22307 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCP2P22307 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCP2P22307 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCP2P22307 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCP2P22307 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCP2P22307 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms