Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN1P21941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MATN1P21941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MATN1P21941 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN1P21941 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN1P21941 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MATN1P21941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MATN1P21941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MATN1P21941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN1P21941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN1P21941 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN1P21941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MATN1P21941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MATN1P21941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN1P21941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN1P21941 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN1P21941 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MATN1P21941 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MATN1P21941 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN1P21941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN1P21941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN1P21941 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MATN1P21941 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN1P21941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN1P21941 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN1P21941 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MATN1P21941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MATN1P21941 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MATN1P21941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MATN1P21941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MATN1P21941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MATN1P21941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN1P21941 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN1P21941 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN1P21941 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MATN1P21941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MATN1P21941 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN1P21941 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN1P21941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN1P21941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MATN1P21941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MATN1P21941 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MATN1P21941 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MATN1P21941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN1P21941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN1P21941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN1P21941 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN1P21941 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN1P21941 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MATN1P21941 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN1P21941 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN1P21941 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN1P21941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN1P21941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MATN1P21941 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN1P21941 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN1P21941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN1P21941 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MATN1P21941 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN1P21941 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN1P21941 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN1P21941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MATN1P21941 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN1P21941 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN1P21941 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN1P21941 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN1P21941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MATN1P21941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms