Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BGNP21810 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BGNP21810 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BGNP21810 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BGNP21810 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BGNP21810 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BGNP21810 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BGNP21810 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BGNP21810 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BGNP21810 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BGNP21810 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BGNP21810 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BGNP21810 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BGNP21810 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BGNP21810 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BGNP21810 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BGNP21810 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms