Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYT1P21579 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYT1P21579 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYT1P21579 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYT1P21579 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYT1P21579 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYT1P21579 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYT1P21579 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYT1P21579 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT1P21579 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT1P21579 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT1P21579 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYT1P21579 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT1P21579 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT1P21579 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT1P21579 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYT1P21579 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYT1P21579 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYT1P21579 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYT1P21579 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYT1P21579 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYT1P21579 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYT1P21579 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT1P21579 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT1P21579 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT1P21579 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT1P21579 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT1P21579 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT1P21579 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT1P21579 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT1P21579 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT1P21579 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT1P21579 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT1P21579 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT1P21579 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT1P21579 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT1P21579 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYT1P21579 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYT1P21579 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYT1P21579 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYT1P21579 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYT1P21579 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SYT1P21579 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYT1P21579 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT1P21579 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT1P21579 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT1P21579 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT1P21579 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYT1P21579 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYT1P21579 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT1P21579 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT1P21579 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT1P21579 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT1P21579 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT1P21579 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYT1P21579 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT1P21579 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT1P21579 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT1P21579 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT1P21579 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT1P21579 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT1P21579 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT1P21579 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT1P21579 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT1P21579 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT1P21579 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT1P21579 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT1P21579 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT1P21579 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT1P21579 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT1P21579 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT1P21579 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT1P21579 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT1P21579 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT1P21579 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT1P21579 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT1P21579 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT1P21579 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT1P21579 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT1P21579 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT1P21579 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT1P21579 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT1P21579 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT1P21579 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT1P21579 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT1P21579 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT1P21579 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT1P21579 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT1P21579 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT1P21579 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT1P21579 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT1P21579 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT1P21579 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT1P21579 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT1P21579 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT1P21579 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYT1P21579 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT1P21579 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT1P21579 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT1P21579 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms