Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms