Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATF3P18847 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATF3P18847 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATF3P18847 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATF3P18847 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATF3P18847 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATF3P18847 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATF3P18847 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ATF3P18847 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATF3P18847 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATF3P18847 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATF3P18847 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATF3P18847 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ATF3P18847 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATF3P18847 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATF3P18847 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ATF3P18847 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATF3P18847 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATF3P18847 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF3P18847 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF3P18847 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF3P18847 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF3P18847 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF3P18847 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF3P18847 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ATF3P18847 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATF3P18847 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATF3P18847 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATF3P18847 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATF3P18847 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
ATF3P18847 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
ATF3P18847 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATF3P18847 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATF3P18847 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATF3P18847 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATF3P18847 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATF3P18847 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATF3P18847 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATF3P18847 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATF3P18847 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ATF3P18847 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATF3P18847 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATF3P18847 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATF3P18847 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATF3P18847 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF3P18847 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF3P18847 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF3P18847 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF3P18847 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF3P18847 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF3P18847 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATF3P18847 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATF3P18847 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATF3P18847 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATF3P18847 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATF3P18847 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATF3P18847 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATF3P18847 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATF3P18847 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATF3P18847 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATF3P18847 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATF3P18847 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATF3P18847 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATF3P18847 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATF3P18847 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATF3P18847 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATF3P18847 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATF3P18847 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ATF3P18847 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATF3P18847 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ATF3P18847 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATF3P18847 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATF3P18847 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATF3P18847 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATF3P18847 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATF3P18847 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATF3P18847 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATF3P18847 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATF3P18847 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF3P18847 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
ATF3P18847 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATF3P18847 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATF3P18847 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATF3P18847 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ATF3P18847 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ATF3P18847 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATF3P18847 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms