Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCK1P16333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCK1P16333 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCK1P16333 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCK1P16333 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCK1P16333 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCK1P16333 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCK1P16333 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCK1P16333 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCK1P16333 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCK1P16333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCK1P16333 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCK1P16333 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCK1P16333 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCK1P16333 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCK1P16333 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCK1P16333 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCK1P16333 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCK1P16333 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCK1P16333 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCK1P16333 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCK1P16333 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCK1P16333 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCK1P16333 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCK1P16333 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCK1P16333 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCK1P16333 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCK1P16333 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCK1P16333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCK1P16333 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCK1P16333 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCK1P16333 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCK1P16333 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCK1P16333 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCK1P16333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCK1P16333 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCK1P16333 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCK1P16333 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCK1P16333 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCK1P16333 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCK1P16333 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCK1P16333 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCK1P16333 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCK1P16333 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCK1P16333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCK1P16333 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCK1P16333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCK1P16333 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCK1P16333 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCK1P16333 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCK1P16333 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCK1P16333 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCK1P16333 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCK1P16333 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCK1P16333 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCK1P16333 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCK1P16333 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCK1P16333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCK1P16333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCK1P16333 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCK1P16333 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCK1P16333 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms